商业连锁物流中心共分常温物流中心和生鲜加工物流中心两个部分，立体仓位30000多个，日配送商品20万件，年吞吐货物能力达到30亿元，主要致力为自营连锁门店及广大用户提供专业仓储、运输和配送服务。

  其中，常温物流中心建筑面积26000平方米，高度16米，采用国际先进RF射频技术和WMS物流信息系统，配备有德国进口林德高位叉车，实现商品入库宾馆化、储存立体化、搬运机械化、管理自动化、配送公交化。

  生鲜加工物流中心建筑面积15000平方米，主要由常温农产品分级分拣和配送区、农产品生产加工区与农产品低温储存区三大产品功能区组成，产品分为净菜、周家口放心馒头、面条、凉皮、豆芽、分割肉、调理鱼共六个生产车间五大系列，700多个品种，是国家农产品现代流通体系建设首批试点项目。通过“农超对接”，实现了农产品原料基地化、生鲜商品加工工厂化、冷链运输系统化，使万果园的生鲜商品达到：早上在田里，中午在店里，晚上在锅里，保证了农产品品质安全，成为周口市民安全放心的“大厨房”。